Les méthodes d'extraction des acides nucléiques sont essentielles en biologie moléculaire et sont couramment utilisées dans de nombreuses applications médicales et en sciences biologiques. L'extraction des acides nucléiques peut être divisée en 3 étapes, qui peuvent être optimisées en fonction du type d'échantillon et des applications en aval pour lesquelles les acides nucléiques seront utilisés. Ces étapes sont les suivantes :
- Rupture des structures des tissus et des cellules
- Élimination des protéines, des lipides et autres contaminants des acides nucléiques
- Transfert des acides nucléiques dans de l'eau ou une solution tampon qui les préservera sans interférer avec les travaux ultérieurs.
Types de méthodes d'extraction
Les méthodes d'extraction des acides nucléiques peuvent être classées en deux types différents :
- Méthodes en solution (comme la méthode phénol-chloroforme)
- Méthodes basées sur la phase solide (comme les billes magnétiques ou les colonnes de centrifugation)
Les méthodes d'extraction en phase solide fonctionnent en faisant se lier les acides nucléiques à des supports solides, tels que des billes magnétiques recouvertes de silice ou d'autres matériaux. Les billes (ou autres supports) sont ensuite lavées avec de l'alcool pour éliminer les contaminants. Le support est ensuite lavé avec un liquide qui rend à nouveau les acides nucléiques solubles, ce qui libère l'ADN du support dans un processus appelé élution. Une méthode simple consiste à ajouter une solution contenant un chaotrope à l'extrait brut d'acides nucléiques. Les agents chaotropes sont des molécules qui perturbent le réseau de liaisons hydrogène entre les molécules d'eau. En présence de chaotropes, les acides nucléiques sont beaucoup moins solubles et se lient aux billes magnétiques recouvertes de silice et autres supports solides – ce qui permet de les séparer facilement des contaminants. Les méthodes d'extraction en phase solide peuvent également dépendre de la liaison sélective de l'ADN et de l'ARN à des résines échangeuses d'ions ou d'autres produits chimiques.
